SHD 촉매 삼중 체 각각의 역할은 무엇입니까? 메커니즘은 어떻게 작동합니까?

SHD 촉매 트라이 어드

그만큼 SHD 촉매 삼중 체그 이름에서 알 수 있듯이 아미노산 (AAs) 세린, 히스티딘 및 아스파 테이트로 구성되어 있으며 각각의 문자 코드는 각각 S, H 및 D입니다.

이런 종류의 삼중 체는 예를 들어 효소 내에 존재합니다 트립신, 이는 췌장에서 발견 될 수 있는데, 먼저 비활성 전구체로 합성됩니다 (그래서 그것이 필요할 때까지는 그 일을하지 않습니다).

트리 펩은 특정 펩티드 결합을 차단합니다.

트립신의 아이디어는 특정한 펩타이드 결합을 가수 분해해야한다는 것입니다. #아르 자형# AA 서열의 그룹 크고 # mathbf ((""+ ")) #. 이것은의 예입니다. 요금 상보성.

하이라이트 된 결합은 하이라이트 된 효소 활성 동안 가수 분해되는 펩타이드 결합입니다 #아르 자형# 그룹.

아미노산의 역할

세린 이 트라이어드에서 친핵체, 만약 양성자가 없다면. 그것을 deprotonated하게하면 정말 도움이 될 것입니다. 이를 성취하기 위해 우리는 무엇인가를 달성해야합니다. 세린의 pKa를 낮추는 것 그래서 양성자를 기증하고 싶어합니다.

히스티딘 에 의해 바람직한 해결책이된다. 활성제 세린으로. 히스티딘의 pKa는 약 6.04이고, 중성 세린의 pKa는 약 15.9이므로, 이것 자체가 일어나지는 않을 것입니다 …

하나, 아스파 테이트 친수성 화합물로서 약 3.90의 pKa 및 음전하를 가지므로 히스티딘 및 아스 파르 테이트가 모두 H- 결합 상호 작용을 형성하도록 산이되고 싶다.

Aspartate의 히스티딘 양성자에 대한 욕구는 히스티딘을 그것의 pKa를 올리다 오른쪽 상단의 양성자를 유지하려면, 균형을 잡는 히스티딘과 세린의 pKa 차이, 세린의 탈 양자화를 촉진시켜 H- 결합 상호 작용을 형성한다.

추가 보너스로 aspartate도 있습니다. 오리엔트 히스티딘을 첨가하여 자유롭게 회전하는 메틸렌 다리가 제 위치에 유지되도록한다. 좋은!

함께, 이들은 트립신 내에서, 예를 들어, 다른 단백질의 특정 펩타이드 결합의 가수 분해 / 절단을 촉매 작용합니다.

생각은 무엇입니까?

음,이 큰 다이어그램은 여기에 있습니다:

1. 히스티딘은 양성자를 세린으로부터 훔쳐 활성화시킵니다.
2. 세린은 이제 사면체 복합체에서 결합하는 카보 닐 탄소를 공격 할 수 있습니다.
3. 복합체는 백본에 의해 안정화된다. # "NH"# 근처의 글리신뿐만 아니라 동일한 세린의 글리신으로부터 히스티딘은 아스파 테이트에 의해 배향된다. 사면체 복합체는 붕괴하여 펩타이드 결합을 절단하고, # "NH"# 양성자를 히스티딘으로부터 훔치지.
4. 히스티딘은 aspartate에 의해 안정화 된 후에도 pKa가 여전히 증가되어 (약한 산으로되어 있음) 물에서 양성자를 얻을 수 있습니다.
5. 수산화물은 두 번째 친 핵성 공격을 위해 카르 보닐 탄소를 공격 할 수있는 훌륭한 친핵체이다.
6. 백본에 의해 다시 안정화 된 사면체 복합체 # "NH"# 글리신과 같은 세린에, 그때 붕괴, 세린을 바로 절단하고 이전처럼 히스티딘 양성자를 잡아낼 수 있습니다.
7. 우리는 펩타이드 결합의 가수 분해의 결과 인 카르 복실 산으로 끝납니다.